Aşırı korumacı bir palyaço balığı olan Marlin, oğlu Nemo ile birlikte Büyük Set Resifi'nde yaşamaktadır. Bir baraküda saldırısının ardından Marlin'in elinde sadece korumaya yemin ettiği Nemo kalır. Yıllar sonra, keşfetmeye hevesli olan Nemo dalgıçlar tarafından yakalanır. Oğlunu bulmaya kararlı olan Marlin, okyanus boyunca uzanan bir yolculuğa çıkar. Ona, kısa süreli hafıza kaybı yaşayan kraliyet mavisi tang balığı Dory eşlik eder. İkili, kendisini Sidney'de bir diş hekiminin ofisindeki akvaryumda bulan Nemo'yu ararken çeşitli zorluklarla ve karşılaşmalarla yüzleşir.
