Yakın gelecekte Empire City, Brandon "Big Boss" Babel ve çetesinin organize ettiği yaygın suçlarla boğuşmaktadır. Yerel polis güçleri yetersiz kalınca Belediye Başkanı Davis federal yardım arayışına girer. Kod adı Bulletproof olan FBI Özel Ajanı Baldwin P. Vess görevlendirilir ancak Big Boss'un adamlarıyla girdiği bir çatışmada ağır yaralanır. Yeni polis şefi olarak atanan ve artık sibernetik bir gövdeye sahip olan Bulletproof, ülkenin dört bir yanından seçkin bir kolluk kuvveti ekibi kurar. Central Organization of Police Specialists (C.O.P.S.) olarak bilinen bu ekip, Big Boss ile mücadele etmek ve Empire City'de düzeni yeniden sağlamakla görevlendirilir.
