23세기, 지구는 중심핵을 도는 수많은 조각으로 갈라져 '스카이랜드'라 불리는 새로운 세계를 이루고 있다. 이 분열된 세계는 수자원을 장악하고 세이진 가디언을 통해 질서를 유지하는 독재 조직 '스피어'가 다스린다. 세이진은 태양 에너지를 흡수해 다양한 특수 능력을 발휘할 수 있도록 진화한 인간이다. 이야기는 어머니가 스피어에게 붙잡힌 뒤의 남매 마하드와 레나를 따라간다. 어린 세이진 레나는 아직 염동력을 다루는 법을 배우는 중이다. 해적단에게 구조된 두 사람은 어머니를 찾고 스카이랜드의 위험을 헤쳐 나가기로 결심하고 스피어에 맞선 반란에 합류한다.
