Dans la ville fictive de Landmark City, cinq adolescents sont recrutés par Janus Lee, de Lee Industries, via un concours télévisé. Les vainqueurs, Axel Manning, Catalina Leone, Crey Kingston, Zack Hawkes et Ollie Sharker, forment une équipe connue sous le nom d'A.T.O.M. (Alpha Teens On Machines). Ils sont chargés de tester des véhicules et des armes expérimentaux, qu'ils utilisent ensuite pour combattre les criminels. Leur principal adversaire est le chef du crime Alexander Paine, qui est lié à la mort du père d'Axel.