2044년 6월, 로보텍 원정군(REF)은 외계 종족 인비드로부터 지구를 탈환하기 위한 최후의 공세를 준비한다. REF 전투기 조종사 중에는 우주에서 태어나 지구를 전혀 모르는 마이아 스털링, 마커스 러시, 알렉스 로메로가 포함되어 있다. 라인하르트 장군은 REF의 최고 군사령관인 릭 헌터를 찾기 위한 구조 임무에 빈스 그랜트 대위를 파견한다. 한편, 저항군 지도자 스콧 버나드는 두 종족 간의 평화를 추구하는 인비드 공주 아리엘을 만난다. 전투가 격화되면서 아리엘은 자신의 어머니인 인비드 레지스가 지구에서 철수하도록 설득하기 위해 노력한다.
